Cấu trúc cốt lõi của Babylon Protocol là blockchain Babylon, một blockchain POS được xây dựng trên Cosmos SDK và tương thích với Cosmos IBC. Nó cho phép tổng hợp và truyền thông dữ liệu giữa chuỗi Bitcoin và các chuỗi ứng dụng Cosmos khác. Người dùng có thể khóa Bitcoin trên mạng Bitcoin để cung cấp an ninh cho các chuỗi tiêu thụ POS khác trong khi kiếm được phần thưởng staking. Babylon cho phép Bitcoin tận dụng tính bảo mật và phi tập trung độc đáo của nó để cung cấp an ninh kinh tế cho các chuỗi POS khác.